Основные функции специальных органов народнохозяйственной системы рационального природопользования обусловлены задачами, на решение которых ориентирована их специфическая деятельность. Параллельно осуществляется наблюдение санитарной службой Минздрава и на этой основе совершенствуются санитарно-гигиенические нормы.

Центральным органом государственного управления и контроля в области рационального использования природных ресурсов является Министерство экологии и природных ресурсов. Основной задачей Минприроды является проведение единой научно-технической политики в области экологии и природопользования.

Функция Минприроды заключается в осуществлении государственного контроля за состоянием природной среды и ее использованием. На Госкомприроду возлагается вся полнота ответственности за охрану природы, организацию рационального использования и воспроизводства природных ресурсов в стране и соответственно его подразделениями на местах, в то же время не подменяя министерства, ведомства. В соответствии с этим на Минприроду возлагаются функции по: - осуществлению комплексного управления природоохранной деятельностью в стране, разработке и проведению единой научно-технической политики в охране природы и рациональном использовании природных ресурсов, координации деятельности министерств, ведомств в этой области;

- государственному контролю за использованием и охраной земель, поверхностных и подземных вод, атмосферного воздуха, растительного (в том числе лесов) и животного мира (в том числе рыбных запасов), морской среды и природных ресурсов территориальных вод, континентального шельфа и экономической зоны, а также общераспространенных полезных ископаемых;

- подготовке и представлению предложений по вопросам охраны природы и рациональному использованию природных ресурсов для включения их В проекты Концепции и Основных направлений экономического и социального развития, планов экономического и социального развития регионов. Министерство организует контроль за выполнением соответствующих заданий, предусмотренных в Основных направлениях и планах;

- разработке предложений по совершенствованию экономического механизма природопользования, экологических нормативов, правил и стандартов по регулированию использования природных ресурсов и охране природной среды от загрязнения и других вредных воздействий. Министерство утверждает указанные нормативы, правила и стандарты;